Windowsにも「セーフモード」での起動がありますが、同様の機能がMacにもあります。起動でトラブルがあったときに試してみる価値があるでしょう。

1. 電源を落とした状態であることを確認してください。
2. 電源ボタンを押してください。
3. 起動音がしたら、すぐに「shift」キーを押したままにしてください。
4. Appleのロゴとその下に回転する円形のインジケータが表示したらキーを離して下さい。
5. セーフブートをしている間、インジケータの下に進行状況を示す横長の棒（バー）が表示されます。 

参考
OS X: セーフブート、セーフモードとは
http://support.apple.com/kb/ht1564?viewlocale=ja_JP